27 de septiembre de 2002-En vez de crear un Órgano Autónomo Interno en forma de fideicomiso, Patricia Zúñiga Cendejas como Secretaria Técnica del Foro Consultivo y José Antonio de la Peña Mena, futuro Coordinador General, crearon el Foro Consultivo Científico y Tecnológico, Asociación Civil (A.C.) con el que duplicarían funciones del estado y se verían beneficiados de fondos públicos.
En ningún momento de la redacción en ambas leyes se contempla que el Foro Consultivo Científico y Tecnológico tenga personalidad jurídica (sin la cual es imposible realizar compras o contratar personal). Lo que realmente se pensó para dicho foro, era fungir como un Órgano Interno dentro de Conacyt, por lo que la existencia de dicha A.C. usurpa el espacio estipulado para el Órgano Interno.